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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

专家详解 “阳康”网红食物******

　　“阳康”后推荐喝奶茶？黄桃罐头除了愉悦心情有实效吗？盐蒸橙子真能缓解“刀片喉”吗？在1月7日举办的上海科普大讲坛上，上海市疾病预防控制中心副主任医师、营养学博士汪正园对当下的一些“阳康”网红食物是否有效、为何有效进行了解答：

　　粥没有错，但更推荐牛奶

　　胃口不太好的情况下，大家可能选择喝粥来“续命”。汪正园说，“粥并没有错，但是粥相对来说，营养比较匮乏，能量密度比较低，吃多后把胃撑起来了，其他一些营养更好或者能量密度更大的食物就吃不下了。”

　　因此，他推荐牛奶或酸奶，“‘阳康’的人胃口不是很好，吃不下东西，甚至我们的嗓子不是很舒服的情况下，更推荐酸奶，因为酸奶能量密度更高，而且对乳糖不耐受人群更友好些。”

　　奶茶登上“推荐榜”

　　碳水化合物让人“又爱又恨”，但在抗病毒时它不可缺。“吃饱了才有力气减肥，同样，吃饱了才有力气对抗病毒。”汪正园说。

　　他表示，一般来说，好的碳水来源是主食和水果，如果真的吃不下，可以喝一些含糖饮料来作为能量的补充；含糖饮料中最推荐奶茶，因为奶茶的能量密度在含糖饮料中是偏高的，奶茶里还会加些料，营养素较一般的饮料丰富。

　　含糖饮料中，他还推荐运动饮料，因为运动饮料有一定的矿物质含量标准，可补充因发烧流汗引起的电解质损失。

　　黄桃罐头不仅是“精神罐头”

　　对于“网红食物”黄桃罐头，汪正园说，黄桃罐头是可以补充维生素和矿物质的，另外，罐头比较“凉爽”，对咽部比较友好，可以提高进食的舒适度。

　　他表示，罐头的甜味也会给大脑提供愉悦信号，“糖分在进入我们身体的时候，可以跟口腔里面的甜味受体结合，促使大脑分泌‘快乐分子’——多巴胺。”

　　盐蒸橙子真能缓解“刀片喉”吗？

　　盐蒸橙子能缓解“刀片喉”，汪正园说，这是因为橙子富含芦丁，芦丁可以降低血管通透性，消除喉咙肿胀。

　　那其他果汁是不是也可以？对于这个问题，他解释，芦丁主要存在于橙皮和橘络(果皮内层筋络)中，蒸食有助芦丁更好地溶解，这样吃起来会更多；而橙汁饮料相对来说芦丁的含量会很低。

　　他还介绍，富含芦丁的水果不仅有柑橘类水果(橙子、橘子、柚子、柠檬等)，还有西红柿、茄子、苦荞等。（记者 郑莹莹）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）